Als Mittelsäuger werden Säugetierarten bezeichnet, die sich gegenüber den Kleinsäugern durch ein etwas höheres Körpergewicht auszeichnen. Zu ihnen zählen einige in Bayern heimische Arten wie beispielsweise Fuchs, Dachs, Baum- und Steinmarder sowie Biber und Fischotter. Das LfU beschäftigt sich auf mehreren fachlichen Ebenen mit dem Biber und mit dem Monitoring der hiesigen Fischotterpopulation.